Revisión genoma mosca drosophila

2001/05/17 Roa Zubia, Guillermo - Elhuyar Zientzia

• Genetika

La empresa Celera Genomics, además del genoma humano, secuenció y publicó el año pasado el genoma de la mosca Drosophila Melanogaster. Ahora, un grupo de científicos de la Universidad de Stanford en California ha realizado un análisis de lo publicado.

La revista Nature publica hoy las conclusiones del estudio. Esta breve comunicación comienza con la siguiente reflexión: "Aunque existen grandes consensos en muchas secuencias génicas, existen muchas discrepancias significativas".

A partir de los datos secuenciados, los de Celera Genomics trataron de predecir los genes codificados. Se anunciaba que la mosca de drosophila tenía 14.226 genes, incluidos otros 550 que podrían existir en combinaciones desconocidas. Pero esta mosca ha sido muy utilizada en los laboratorios, por lo que los bioquímicos del mundo han almacenado los datos recopilados durante años en una base de datos. Esta base de datos se denomina SwissProt. Los científicos de Stanford han comparado estas dos fuentes de datos. Cabe destacar que estos científicos son matemáticos, expertos en bases de datos.

La comparación se realizó con una muestra de 1.049 genes tomados de la base de datos SwissProt. Tan sólo el 26,2% de los genes comparados con los datos de la empresa eran idénticos. El 28,8% tiene datos iguales en longitud pero modificados. El resto de genes presentaba diferencias significativas (superior al 1%) en las secuencias especificadas en ambas fuentes.

En la base de datos SwissProt se ha recopilado un trabajo de mucho tiempo, por lo que muchas veces ya ha sido verificado. Este breve artículo de la revista Nature cuestiona la fiabilidad de la metodología desarrollada por la empresa. Según los autores, la utilización de los datos del genoma de Drosophila limita considerablemente la investigación de la proteoma y probablemente esta conclusión también servirá para el caso del genoma humano.