Ordenadores y biología: uno alimenta al otro

2003/02/20 Carton Virto, Eider - Elhuyar Zientzia

• Hardwarea

Cada año, en homenaje a Alan Tuning, pionero en el mundo de los ordenadores, se celebra la Conferencia de Tuning. Este año la charla ha sido impartida por Carol Kovac de IBM. Kovac es el jefe del departamento de Ciencias de la Vida en IBM y ha hablado sobre su tema, la relación entre la biología y los ordenadores. Y, de paso, ha anunciado el próximo ordenador de IBM.

Kovac observa grandes similitudes en el desarrollo de ambas áreas. En los últimos años, considera que la biología se está acercando a la ley de Moore. La ley de Moore predice que la capacidad de los chips aumenta exponencialmente y se duplica cada 18 meses. "Los bioinformáticos piden más capacidad que nunca a los ordenadores y, por tanto, a los autores de los ordenadores, lo que va a guiar el desarrollo de los ordenadores", ha afirmado Kovac. Precisamente, una de sus tareas es la búsqueda de socios para realizar inversiones en esta línea.

Con el objetivo de investigar en el campo de la biología y sobre todo en el genoma, IBM comercializará el ordenador Blue Gene. Este ordenador será capaz de realizar 360.000 millones de operaciones por segundo, más de las 500 mejores supercomputadoras disponibles en la actualidad. Blue Gen contará con 65.536 procesadores en parejas que trabajan paralelamente y consumirá 20 Kilowatios por hora. En relación coste/resultado, Deep Blue será 20 veces mejor que el pionero. Deep Blue, cuando nació, contaba con 256 procesadores y podía operar entre 100 y 200 mil millones. Para referirse, los ordenadores convencionales tienen un procesador, dos, cuatro, ocho.

Kovac cree que las posibilidades de gestionar y analizar la información genética con este tipo de ordenadores se multiplicarán, y que el conocimiento que de ello se derive impulsará su trabajo. Los clientes.

Kovac también abordó el formato más adecuado para gestionar toda esta información. Lo ve al formato XML de grandes futuros. Actualmente se utiliza mucho en Internet y por su naturaleza puede ser muy apropiado para la gestión de datos genéticos, tiene código abierto y es gratuito.