Ordinateurs et biologie : l'un nourrit l'autre

2003/02/20 Carton Virto, Eider - Elhuyar Zientzia

• Hardwarea

Chaque année, en hommage à Alan Tuning, pionnier dans le monde des ordinateurs, se tient la Conférence de Tuning. Cette année l'entretien a été donné par Carol Kovac d'IBM. Kovac est le chef du département des sciences de la vie à IBM et a parlé de son sujet, la relation entre la biologie et les ordinateurs. Et, au passage, a annoncé le prochain ordinateur d'IBM.

Kovac observe de grandes similitudes dans le développement des deux domaines. Ces dernières années, il estime que la biologie est proche de la loi de Moore. La loi de Moore prévoit que la capacité des puces augmente exponentiellement et est doublée tous les 18 mois. « Les bioinformatiques demandent plus de capacité que jamais aux ordinateurs et donc aux auteurs des ordinateurs, ce qui va guider le développement des ordinateurs », a déclaré Kovac. Précisément, une de ses tâches est la recherche de partenaires pour réaliser des investissements dans cette ligne.

Afin d'étudier dans le domaine de la biologie et surtout dans le génome, IBM commercialisera l'ordinateur Blue Gene. Cet ordinateur sera en mesure d'effectuer 360.000 millions d'opérations par seconde, plus des 500 meilleurs superordinateurs disponibles aujourd'hui. Blue Gen comptera 65 536 processeurs par paires travaillant en parallèle et consommera 20 kilowatts par heure. Par rapport au coût/résultat, Deep Blue sera 20 fois mieux que le pionnier. À sa naissance, Deep Blue comptait 256 processeurs et pouvait fonctionner entre 100 et 200 milliards. Pour se référer, les ordinateurs classiques ont un processeur, deux, quatre, huit.

Kovac pense que les possibilités de gérer et d'analyser l'information génétique avec ce type d'ordinateurs se multiplieront, et que la connaissance qui en découlera stimulera son travail. Les clients.

Kovac a également abordé le format le plus approprié pour gérer toutes ces informations. Il le voit au format XML des grands futurs. Il est actuellement largement utilisé sur Internet et par sa nature peut être très approprié pour la gestion des données génétiques, a open source et est gratuit.