Séquencer le génome d'une personne décédée lors de la destruction de Pompéi

2022/05/26 Agirre Ruiz de Arkaute, Aitziber - Elhuyar Zientzia Iturria: Elhuyar aldizkaria

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Lorsque la gigantesque éruption du Vésuve a détruit Pompéi en 79, des milliers de personnes sont mortes par les maisons tombées ou noyées leurs cendres toxiques. Beaucoup d'entre eux ont conservé leurs os pitrifiés jusqu'à présent, et pour la première fois, les chercheurs ont réussi à extraire l'ADN des restes de l'un et à le séquencer complètement.

L’un des deux individus trouvés dans la Maison de l’Artisan est le séquencé. Ils sont un homme de 35 à 40 ans et une femme de plus de 50 ans qui apparaissaient ensemble dans la salle à manger de la maison. Les deux ont extrait l'ancien ADN, mais seul le masculin a pu le séquencer complètement. L'étude a été diffusée par le magazine Scientific Reports.

Après analyse du squelette, il est précisé qu'il avait quelques côtes cassées, probablement par éruption. Et, lors de l'analyse de l'ADN, des restes d'ADN de bactéries du genre Mycobacterium apparaissent. Par conséquent, les chercheurs croient que l'homme était malade de tuberculose. L’expansion de l’Empire romain a entraîné dans de nombreux endroits une augmentation de la densité de la population, et ce mode de vie urbain a provoqué l’expansion de la tuberculose, qui est devenue endémique.

Le génome de l’homme est aussi un signe de la grande diversité génétique qui existait dans la péninsule italienne pendant l’Empire romain. En fait, l'étude de l'ADN mitochondrial et de l'ADN du chromosome Y a révélé que l'homme, outre les caractéristiques des Italiens de l'époque, avait un certain nombre de traits caractéristiques de l'île de Sardaigne. Ils n'ont pas été en mesure de préciser s'il était de la population locale de Pompéi ou d'origine extérieure, mais les enquêteurs affirment qu'il n'était pas migrant en provenance d'Italie pour esclavage.

Pathogènes et mode de vie

Les éruptions de Vesuvio ont préservé les os de nombreuses personnes mortes et les chercheurs indiquent la possibilité de récupérer et séquencer l'ADN d'un plus grand nombre de personnes. Ils considèrent que les matériaux pyroplastiques ouverts en éruption protégeraient l’ADN de la dégradation causée par l’oxygène atmosphérique.

Ils croient que séquencer le génome des individus disponibles peut aider à comprendre la vie et l'histoire génétique de l'époque. Ils prétendent même qu'il pourrait permettre de détecter la présence d'agents pathogènes transmis par le sang. En fait, la technique de PCR avait de grandes limites pour séquencer l'ADN complet, mais le séquençage actuel de shotgun et d'autres avancées actuelles ont augmenté les possibilités de séquencer le génome complet.