Pliez avant de commencer à travailler!

2002/09/25 Roa Zubia, Guillermo - Elhuyar Zientzia

• Biokimika

Bien que formé en chaîne, les protéines doivent être pliées à une structure tridimensionnelle pour fonctionner. D'une certaine manière, ces structures réalisent leur travail en entourant une petite molécule et en les embrassant. Mais pour cela, la protéine ne se plie pas de toute façon, parce qu'il ne fonctionne que l'une des mille formes qu'il peut adopter. Et c'est que, comme la cellule synthétise, la protéine se plie par elle-même et toujours (ou presque toujours) s'adapte à cette seule position efficace.

Cependant, quand les scientifiques le font en laboratoire ils n'obtiennent pas ce résultat. Les protéines synthétiques, bien qu'ayant la même composition chimique que celle produite dans la nature, n'acquièrent pas leur aspect ; elles se dénaturent dans le processus de pliage. Les biochimiques sont très préoccupés par ce problème. Comment se plient les protéines dans la nature? Étant donné la composition d'une certaine protéine, est-il possible de connaître la structure finale? Le scientifique qui réussit à répondre à ces questions sera probablement candidat au Prix Nobel.

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Les lignes de recherche abordées dans ce but sont logiquement nombreuses. Mais la plupart des sessions n'ont pas avancé. Les tests ont été effectués en laboratoire et sur ordinateur. Par exemple, un groupe a essayé d'étudier le pliage spontané, étendant une protéine naturelle et la laissant se plier. Mais il est très difficile de comprendre des comportements généraux de ce type de sessions.

Maintenant, une équipe a obtenu quelque chose avec une autre méthode. Dans une simulation par ordinateur, ils ont réussi à prédire comment se plie une petite protéine composée de 20 acides aminés. C'est un travail difficile, car la protéine se replie par des 'principes' complexes, que l'équipe du chercheur Carlos Simmerling a obtenu au moins une fois. La protéine utilisée, Trp-cage, est de 20 acides aminés et la plupart du corps humain a des centaines d'acides aminés, mais c'est le point de départ. Les mêmes sont sur la bonne voie. Il faudra maintenant voir si cette méthodologie est adaptée à n'importe quelle protéine de 20 acides aminés ou ne fonctionne que dans ce cas. Cependant, il faut parler de succès et laisser ouverte une porte à l'espoir.